海洋微生物助永續發展！顧銓、何攖寧、曾庸哲、陳立涵、何銘洋揭共生奧妙
第八屆亞洲微生物體趨勢論壇
海洋微生物助永續發展！顧銓、何攖寧、曾庸哲、陳立涵、何銘洋揭共生奧妙
何攖寧：第三代定序助攻探索海洋新種微菌
海洋大學海洋生物研究所助理教授何攖寧指出，海洋微生物的滅絕比一般物種更難發覺，因此鑑定它們的工作就如同在海洋探索「暗物質」。他表示，據估計地球上應該有多達220萬到430萬種微生物，但迄今卻只有2萬種以上的原核生物被發現，更有超過6.5萬種原核生物雖然已經被充分鑑定、卻無法培養。
何攖寧表示，傳統上鑑定海洋微生物必須透過培養、使微菌分離(isolate)後才能鑑定，現在則是得力於宏基因體學(metagenomics)、第三代高通量定序、單細胞定序、化學代謝體分析等技術，有機會在採樣現場就初步為樣本中未知的細菌分類，更快找到新種，特別是利用長片段序列(long reads)組裝基因體，即使是遇到混菌的狀況也能達到一定程度的鑑別度。
此外在培養微生物鑑種工作上，何攖寧團隊也發現，要發現海水中的新微生物種類，不見得要用營養最豐富的培養基，反向操作利用養分貧乏的培養基也能做到，例如在橈腳類身上發現新種附生細菌Grimontia copepodii、在珊瑚礁和貝類發現的新弧菌屬(Vibrio)細菌等。
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