規章辦法
學生規章
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所碩士班研究生修業規則（114.12.17更新）
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所博士班研究生修業規則（114.12.17更新）
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所碩士學位課程先修辦法
海洋生物研究所逕修讀博士學位辦法
海洋生物研究所外國學生入學辦法
論文指導教授與研究生互動準則
指導教授同意書
研究生更換指導教授聲明書與同意書
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所碩士學位課程先修辦法
教師規章
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所教師升等評審辦法(115.2.26更新)
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所教師新聘辦法(115.2.26更新)
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所教師評鑑辦法（114.12.5更新）
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所教師暨研究人員評審委員會設置辦法(115.2.26更新)
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所所長遴選辦法(112.12.26更新)
所務規章
生命科學院海洋生物研究所課程委員會設置辦法
海洋生物研究所綜合二館B05室使用規則
海洋生物研究所公共教室與設備物品管理辦法
海洋生物研究所公用手提電腦管理辦法
海洋生物研究所公用研究生室使用辦法 (109.09.15更新)
海洋生物研究所超低溫冷凍櫃使用規則(108.09.24更新)
海洋生物所傑出所友遴選辦法
國立臺灣海洋大學生命科學院海洋生物研究所招生委員會設置辦法