本所從事以海洋生物為特色之專業研究，畢業生之發展領域廣泛分布於教育與研究機構，還擴及醫藥、養殖、保育等相關產業，並非只侷限在水產相關事業，顯示本所畢業生發展空間相當寬廣，本所所給予之專業知識與技能足以滿足畢業生就業所需。

本所畢業生有在研究機構（中研院、自然科學博物館、海生館、海科館、水試所等）從事學術研究的，有在學校屏科大、慈惠醫護專校、各地高中職及中小學）擔任教師的，有在各縣市政府擔任生態保育要職的，也有在醫藥保育等行業從事研發工作的，也有許多碩士班畢業生繼續攻讀博士班。

畢業後發展

一、主要進修領域

1.海洋生物研究所

2.生物相關研究所

二、就業管道

1.政府機構或研究機構

2.學校教師

3.生物環保相關私人企業

更新日期：2023年11月30日